Python 馬氏距離求取函數詳解
馬氏距離區別於歐式距離,如百度知道中所言:
馬氏距離(Mahalanobis distance)是由印度統計學傢馬哈拉諾比斯(P. C. Mahalanobis)提出的,表示點與一個分佈之間的距離。它是一種有效的計算兩個未知樣本集的相似度的方法。與 歐氏距離不同的是,它考慮到各種特性之間的聯系(例如:一條關於身高的信息會帶來一條關於體重的信息,因為兩者是有關聯的),並且是尺度無關的(scale-invariant),即獨立於測量尺度。對於一個均值為μ, 協方差矩陣為Σ的多變量向量,其馬氏距離為sqrt( (x-μ)’Σ^(-1)(x-μ) )。
因此,對於馬氏距離最終的定義式為:
上代碼,將馬氏距離求取式,封裝為Python函數,拷貝即可使用:
from numpy import * import numpy def get_mahalanobis(x, i, j): xT = x.T # 求轉置 D = numpy.cov(xT) # 求協方差矩陣 invD = numpy.linalg.inv(D) # 協方差逆矩陣 assert 0 <= i < x.shape[0], "點 1 索引超出樣本范圍。" assert -1 <= j < x.shape[0], "點 2 索引超出樣本范圍。" x_A = x[i] x_B = x.mean(axis=0) if j == -1 else x[j] tp = x_A - x_B return numpy.sqrt(dot(dot(tp, invD), tp.T))
使用方式如下:
if __name__ == '__main__': # 初始化數據點集,或者從其它地方加載 x = numpy.array([[3, 4], [5, 6], [2, 2], [8, 4]]) # 求第0個點到均值之間的馬氏距離(j為-1時代表均值) print(get_mahalanobis(x, 0, -1)) # 求第0個點到第1個點之間的馬氏距離 print(get_mahalanobis(x, 0, 1)) # 求第2個點到第3個點之間的馬氏距離(索引從0開始算起) print(get_mahalanobis(x, 2, 3))
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總結
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