Pandas加速代碼之避免使用for循環
前言
使用Pandas dataframe執行數千甚至數百萬次計算仍然是一項挑戰。你不能簡單的將數據丟進去,編寫Python for循環,然後希望在合理的時間內處理數據。
Pandas是為一次性處理整個行或列的矢量化操作而設計的,循環遍歷每個單元格、行或列並不是它的設計用途。所以,在使用Pandas時,你應該考慮高度可並行化的矩陣運算。
本文將教你如何使用Pandas設計使用的方式,並根據矩陣運算進行思考。在此過程中,我們將向你展示一些實用的節省時間的技巧和竅門,這些技巧和技巧將使你的Pandas代碼比那些可怕的Python for循環更快地運行!
數據準備
在本文中,我們將使用經典的鳶尾花數據集。
現在讓我們建立一個標準線,用Python for循環來測量我們的速度。我們將通過循環遍歷每一行來設置要在數據集上執行的計算,然後測量整個操作的速度。這將為我們提供一個基準,以瞭解我們的新優化對我們有多大幫助。
在上面的代碼中,我們創建瞭一個基本函數,它使用If-Else語句根據花瓣的長度選擇花的類。我們編寫瞭一個for循環,通過循環dataframe對每一行應用函數,然後測量循環的總時間。
在i7-8700k計算機上,循環運行5次平均需要0.01345秒。
使用.iterrows()
我們可以做的最簡單但非常有價值的加速是使用Pandas的內置 .iterrows() 函數。
在上一節中編寫for循環時,我們使用瞭 range() 函數。然而,當我們在Python中對大范圍的值進行循環時,生成器往往要快得多。
Pandas的 .iterrows() 函數在內部實現瞭一個生成器函數,該函數將在每次迭代中生成一行Dataframe。更準確地說,.iterrows() 為DataFrame中的每一行生成(index, Series)的對(元組)。這實際上與在原始Python中使用 enumerate() 之類的東西是一樣的,但運行速度要快得多!
生成器(Generators)
生成器函數允許你聲明一個行為類似迭代器的函數,也就是說,它可以在for循環中使用。這大大簡化瞭代碼,並且比簡單的for循環更節省內存。
考慮這樣一個例子,我們想把1到1000之間的所有數字加起來。下面代碼的第一部分說明瞭如何使用for循環來實現這一點。
如果列表很小,比如長度為1000,那就很好瞭。當你想要處理一個龐大的列表時,比如10億個浮點數,問題就出現瞭。使用for循環,在內存中創建瞭大量的內存huge列表,並不是每個人都有無限的RAM來存儲這樣的東西!Python中的range()函數也做同樣的事情,它在內存中構建列表
代碼的第(2)節演示瞭使用Python生成器對數字列表求和。生成器將創建元素並僅在需要時將它們存儲在內存中。一次一個。這意味著,如果必須創建10億個浮點數,那麼隻能一次將它們存儲在內存中。Python中的xrange()函數使用生成器來構建列表。
也就是說,如果你想多次迭代列表並且它足夠小以適應內存,那麼使用for循環和range函數會更好。這是因為每次訪問list值時,生成器和xrange都會重新生成它們,而range是一個靜態列表,並且內存中已存在整數以便快速訪問。
下面我們修改瞭代碼,使用.iterrows()代替常規的for循環。在我上一節測試所用的同一臺機器上,平均運行時間為0.005892秒,速度提高瞭2.28倍!
使用.apply()
iterrows()函數極大地提高瞭速度,但我們還遠遠沒有完成。請始終記住,當使用為向量操作設計的庫時,可能有一種方法可以在完全沒有for循環的情況下最高效地完成任務。
為我們提供此功能的Pandas功能是 .apply() 函數。apply()函數接受另一個函數作為輸入,並沿著DataFrame的軸(行、列等)應用它。在傳遞函數的這種情況下,lambda通常可以方便地將所有內容打包在一起。
在下面的代碼中,我們已經完全用.apply()和lambda函數替換瞭for循環,打包所需的計算。這段代碼的平均運行時間是0.0020897秒,比原來的for循環快6.44倍。
apply()之所以快得多,是因為它在內部嘗試遍歷Cython迭代器。如果你的函數針對Cython進行瞭優化,.apply()將使你的速度更快。額外的好處是,使用內置函數可以生成更幹凈、更可讀的代碼!
最後
前面我們提到過,如果你正在使用一個為向量化操作設計的庫,你應該總是在沒有for循環的情況下尋找一種方法來進行任何計算。
類似地,以這種方式設計的許多庫,包括Pandas,都將具有方便的內置函數,可以執行你正在尋找的精確計算,但速度更快。
Pandas的 .cut() 函數將一組bin定義為輸入,這些bin定義瞭If-Else的每個范圍和一組標簽。這與我們用 compute_class() 函數手動編寫有完全相同的操作。
看下面的代碼,看看.cut()是如何工作的。我們又一次得到瞭更幹凈、更可讀的代碼。最後,.cut()函數平均運行0.001423秒,比原來的for循環快瞭9.39倍!
好瞭,到此這篇關於Pandas加速代碼之避免使用for循環的文章就介紹到這瞭,更多相關Pandas for循環內容請搜索WalkonNet以前的文章或繼續瀏覽下面的相關文章希望大傢以後多多支持WalkonNet!
推薦閱讀:
- pandas提升計算效率的一些方法匯總
- 解析pandas apply() 函數用法(推薦)
- python中pandas操作apply返回多列的實現
- pandas中關於apply+lambda的應用
- Pandas數據結構詳細說明及如何創建Series,DataFrame對象方法