FP-growth算法發現頻繁項集——構建FP樹
FP代表頻繁模式(Frequent Pattern),算法主要分為兩個步驟:FP-tree構建、挖掘頻繁項集。
FP樹表示法
FP樹通過逐個讀入事務,並把事務映射到FP樹中的一條路徑來構造。由於不同的事務可能會有若幹個相同的項,因此它們的路徑可能部分重疊。路徑相互重疊越多,使用FP樹結構獲得的壓縮效果越好;如果FP樹足夠小,能夠存放在內存中,就可以直接從這個內存中的結構提取頻繁項集,而不必重復地掃描存放在硬盤上的數據。
一顆FP樹如下圖所示:
通常,FP樹的大小比未壓縮的數據小,因為數據的事務常常共享一些共同項,在最好的情況下,所有的事務都具有相同的項集,FP樹隻包含一條節點路徑;當每個事務都具有唯一項集時,導致最壞情況發生,由於事務不包含任何共同項,FP樹的大小實際上與原數據的大小一樣。
FP樹的根節點用φ表示,其餘節點包括一個數據項和該數據項在本路徑上的支持度;每條路徑都是一條訓練數據中滿足最小支持度的數據項集;FP樹還將所有相同項連接成鏈表,上圖中用藍色連線表示。
為瞭快速訪問樹中的相同項,還需要維護一個連接具有相同項的節點的指針列表(headTable),每個列表元素包括:數據項、該項的全局最小支持度、指向FP樹中該項鏈表的表頭的指針。
構建FP樹
現在有如下數據:
FP-growth算法需要對原始訓練集掃描兩遍以構建FP樹。
第一次掃描,過濾掉所有不滿足最小支持度的項;對於滿足最小支持度的項,按照全局最小支持度排序,在此基礎上,為瞭處理方便,也可以按照項的關鍵字再次排序。
第一次掃描的後的結果
第二次掃描,構造FP樹。
參與掃描的是過濾後的數據,如果某個數據項是第一次遇到,則創建該節點,並在headTable中添加一個指向該節點的指針;否則按路徑找到該項對應的節點,修改節點信息。具體過程如下所示:
事務001,{z,x}
事務002,{z,x,y,t,s}
事務003,{z}
事務004,{x,s,r}
事務005,{z,x,y,t,r}
事務006,{z,x,y,t,s}
從上面可以看出,headTable並不是隨著FPTree一起創建,而是在第一次掃描時就已經創建完畢,在創建FPTree時隻需要將指針指向相應節點即可。從事務004開始,需要創建節點間的連接,使不同路徑上的相同項連接成鏈表。
代碼如下:
def loadSimpDat(): simpDat = [['r', 'z', 'h', 'j', 'p'], ['z', 'y', 'x', 'w', 'v', 'u', 't', 's'], ['z'], ['r', 'x', 'n', 'o', 's'], ['y', 'r', 'x', 'z', 'q', 't', 'p'], ['y', 'z', 'x', 'e', 'q', 's', 't', 'm']] return simpDat def createInitSet(dataSet): retDict = {} for trans in dataSet: fset = frozenset(trans) retDict.setdefault(fset, 0) retDict[fset] += 1 return retDict class treeNode: def __init__(self, nameValue, numOccur, parentNode): self.name = nameValue self.count = numOccur self.nodeLink = None self.parent = parentNode self.children = {} def inc(self, numOccur): self.count += numOccur def disp(self, ind=1): print(' ' * ind, self.name, ' ', self.count) for child in self.children.values(): child.disp(ind + 1) def createTree(dataSet, minSup=1): headerTable = {} #此一次遍歷數據集, 記錄每個數據項的支持度 for trans in dataSet: for item in trans: headerTable[item] = headerTable.get(item, 0) + 1 #根據最小支持度過濾 lessThanMinsup = list(filter(lambda k:headerTable[k] < minSup, headerTable.keys())) for k in lessThanMinsup: del(headerTable[k]) freqItemSet = set(headerTable.keys()) #如果所有數據都不滿足最小支持度,返回None, None if len(freqItemSet) == 0: return None, None for k in headerTable: headerTable[k] = [headerTable[k], None] retTree = treeNode('φ', 1, None) #第二次遍歷數據集,構建fp-tree for tranSet, count in dataSet.items(): #根據最小支持度處理一條訓練樣本,key:樣本中的一個樣例,value:該樣例的的全局支持度 localD = {} for item in tranSet: if item in freqItemSet: localD[item] = headerTable[item][0] if len(localD) > 0: #根據全局頻繁項對每個事務中的數據進行排序,等價於 order by p[1] desc, p[0] desc orderedItems = [v[0] for v in sorted(localD.items(), key=lambda p: (p[1],p[0]), reverse=True)] updateTree(orderedItems, retTree, headerTable, count) return retTree, headerTable def updateTree(items, inTree, headerTable, count): if items[0] in inTree.children: # check if orderedItems[0] in retTree.children inTree.children[items[0]].inc(count) # incrament count else: # add items[0] to inTree.children inTree.children[items[0]] = treeNode(items[0], count, inTree) if headerTable[items[0]][1] == None: # update header table headerTable[items[0]][1] = inTree.children[items[0]] else: updateHeader(headerTable[items[0]][1], inTree.children[items[0]]) if len(items) > 1: # call updateTree() with remaining ordered items updateTree(items[1:], inTree.children[items[0]], headerTable, count) def updateHeader(nodeToTest, targetNode): # this version does not use recursion while (nodeToTest.nodeLink != None): # Do not use recursion to traverse a linked list! nodeToTest = nodeToTest.nodeLink nodeToTest.nodeLink = targetNode simpDat = loadSimpDat() dictDat = createInitSet(simpDat) myFPTree,myheader = createTree(dictDat, 3) myFPTree.disp()
上面的代碼在第一次掃描後並沒有將每條訓練數據過濾後的項排序,而是將排序放在瞭第二次掃描時,這可以簡化代碼的復雜度。
控制臺信息:
項的順序對FP樹的影響
值得註意的是,對項的關鍵字排序將會影響FP樹的結構。下面兩圖是相同訓練集生成的FP樹,圖1除瞭按照最小支持度排序外,未對項做任何處理;圖2則將項按照關鍵字進行瞭降序排序。樹的結構也將影響後續發現頻繁項的結果。
圖1 未對項的關鍵字排序
圖2 對項的關鍵字降序排序
總結
本派文章就到這裡瞭,下篇繼續,介紹如何發現頻繁項集。希望能給你帶來幫助,也希望您能夠多多關註WalkonNet的更多內容!
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