python數據分析之DataFrame內存優化

💃今天看案例的時候看見瞭一個關於pandas數據的內存壓縮功能,特地來記錄一下。

🎒先說明一下情況,pandas處理幾百兆的dataframe是沒有問題的,但是我們在處理幾個G甚至更大的數據時,就會特別占用內存,對內存小的用戶特別不好,所以對數據進行壓縮是很有必要的。

1. pandas查看數據占用大小

給大傢看一下這麼查看自己的內存大小(user_log是dataframe的名字)

#方法1 就是使用查看dataframe信息的命令
user_log.info()
#方法2 使用memory_usage()或者getsizeof(user_log)
import time
import sys
print('all_data占據內存約: {:.2f} GB'.format(user_log.memory_usage().sum()/ (1024**3)))
print('all_data占據內存約: {:.2f} GB'.format(sys.getsizeof(user_log)/(1024**3)))

我這裡有個dataframe文件叫做user_log,原始大小為1.91G,然後pandas讀取出來,內存使用瞭2.9G。

看一下原始數據大小:1.91G

在這裡插入圖片描述

pandas讀取後的內存消耗:2.9G

在這裡插入圖片描述

2. 對數據進行壓縮

  • 數值類型的列進行降級處理(‘int16′, ‘int32′, ‘int64′, ‘float16′, ‘float32′, ‘float64’)
  • 字符串類型的列轉化為類別類型(category)
  • 字符串類型的列的類別數超過總行數的一半時,建議使用object類型

我們這裡主要采用對數值型類型的數據進行降級,說一下降級是什麼意思意思呢,可以比喻為一個一個抽屜,你有一個大抽屜,但是你隻裝瞭鑰匙,這就會有很多空間浪費掉,如果我們將鑰匙放到一個小抽屜裡,就可以節省很多空間,就像字符的類型int32 比int8占用空間大很多,但是我們的數據使用int8類型就夠瞭,這就導致數據占用瞭很多空間,我們要做的就是進行數據類型轉換,節省內存空間。

壓縮數值的這段代碼是從天池大賽的某個項目中看見的,查閱資料後發現,大傢壓縮內存都是基本固定的函數形式

def reduce_mem_usage(df):
    starttime = time.time()
    numerics = ['int16', 'int32', 'int64', 'float16', 'float32', 'float64']
    start_mem = df.memory_usage().sum() / 1024**2
    for col in df.columns:
        col_type = df[col].dtypes
        if col_type in numerics:
            c_min = df[col].min()
            c_max = df[col].max()
            if pd.isnull(c_min) or pd.isnull(c_max):
                continue
            if str(col_type)[:3] == 'int':
                if c_min > np.iinfo(np.int8).min and c_max < np.iinfo(np.int8).max:
                    df[col] = df[col].astype(np.int8)
                elif c_min > np.iinfo(np.int16).min and c_max < np.iinfo(np.int16).max:
                    df[col] = df[col].astype(np.int16)
                elif c_min > np.iinfo(np.int32).min and c_max < np.iinfo(np.int32).max:
                    df[col] = df[col].astype(np.int32)
                elif c_min > np.iinfo(np.int64).min and c_max < np.iinfo(np.int64).max:
                    df[col] = df[col].astype(np.int64)
            else:
                if c_min > np.finfo(np.float16).min and c_max < np.finfo(np.float16).max:
                    df[col] = df[col].astype(np.float16)
                elif c_min > np.finfo(np.float32).min and c_max < np.finfo(np.float32).max:
                    df[col] = df[col].astype(np.float32)
                else:
                    df[col] = df[col].astype(np.float64)
    end_mem = df.memory_usage().sum() / 1024**2
    print('-- Mem. usage decreased to {:5.2f} Mb ({:.1f}% reduction),time spend:{:2.2f} min'.format(end_mem,
                                                                                                           100*(start_mem-end_mem)/start_mem,
                                                                                                           (time.time()-starttime)/60))
    return df

用壓縮的方式將數據導入user_log2中

#首先讀取到csv中如何傳入函數生稱新的csv
user_log2=reduce_mem_usage(pd.read_csv(r'/Users/liucong/MainFiles/ML/tianchi/tianmiao/user_log_format1.csv'))

讀取成功:內訓大小為890.48m 減少瞭69.6%,效果顯著

在這裡插入圖片描述

查看壓縮後的數據集信息:類型發生瞭變化,數量變小瞭

在這裡插入圖片描述

3. 參考資料

《天池大賽》
《kaggle大賽》
鏈接: pandas處理datafarme節約內存.

到此這篇關於python數據分析之DataFrame內存優化的文章就介紹到這瞭,更多相關python DataFrame內存優化內容請搜索WalkonNet以前的文章或繼續瀏覽下面的相關文章希望大傢以後多多支持WalkonNet!

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