Rcpp和RcppArmadillo創建R語言包的實現方式
1. 預先準備
Windows下需要安裝Rtools,R中裝好Rcpp和RcppArmadillo。創建C++源文件func.cpp
,自定義頭文件test_h.h
。
源文件示例func.cpp
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]] // [[Rcpp::plugins(cpp11)]] #include <RcppArmadillo.h> #include <vector> #include "./test_h.h" using namespace Rcpp; using namespace std; // using namespace arma; // [[Rcpp::export]] RObject func(){ arma::cube A(3,4,5,arma::fill::randu); std::cout<<CONDIT<<std::endl; return wrap(A); }
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
:用於指明需要使用RcppArmadillo。
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
:指明需要使用C++11。
#include "./test_h.h"
:表示使用第三方頭文件。第三方頭文件需要用雙引號""
包括起來,並加上.h
。./
表示在當下文件夾(src)下搜尋文件。
// using namespace arma;
不一定有用。如果要用Armadillo的數據結構,在其之前需指明arma::
。
func()
函數將可以直接在R中調用。
頭文件示例test_h.h
#include <iostream> #define CONDIT 1000
2. 創建R包步驟
新建R Package
選擇Package w/Rcpp, 並添加源文件。或者建立包以後,手動復制到src文件夾下。
R包的文件結構
修改DESCRIPTION文件
將RcppArmadillo添加進Imports和LinkingTo中。
Package: RcppPackTest Type: Package Title: What the Package Does (Title Case) Version: 0.1.0 Author: Who wrote it Maintainer: The package maintainer <[email protected]> Description: More about what it does (maybe more than one line) Use four spaces when indenting paragraphs within the Description. License: What license is it under? Encoding: UTF-8 LazyData: true Imports: Rcpp (>= 0.12.11), RcppArmadillo LinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo
Build & Reload 建立包
3. C++11標準問題
如果要使用C++11標準,第一種方法是在Makevars文件中添加如下代碼:
CXX = g++-4.8.1 PKG_CXXFLAGS = -std=c++11
第二種方法是在.cpp文件前添加// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
以上就是Rcpp和RcppArmadillo創建R包實現方式的詳細內容,更多關於Rcpp和RcppArmadillo創建R包的資料請關註WalkonNet其它相關文章!
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