Rcpp和RcppArmadillo創建R語言包的實現方式

1. 預先準備

Windows下需要安裝Rtools,R中裝好Rcpp和RcppArmadillo。創建C++源文件func.cpp,自定義頭文件test_h.h

源文件示例func.cpp

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
#include <RcppArmadillo.h>
#include <vector>
#include "./test_h.h"

using namespace Rcpp;
using namespace std;
// using namespace arma;

// [[Rcpp::export]]
RObject func(){
  arma::cube A(3,4,5,arma::fill::randu);
  std::cout<<CONDIT<<std::endl;
  return wrap(A);
}

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]:用於指明需要使用RcppArmadillo。

// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]:指明需要使用C++11。

#include "./test_h.h":表示使用第三方頭文件。第三方頭文件需要用雙引號""包括起來,並加上.h./表示在當下文件夾(src)下搜尋文件。

// using namespace arma;不一定有用。如果要用Armadillo的數據結構,在其之前需指明arma::

func()函數將可以直接在R中調用。

頭文件示例test_h.h

 

#include <iostream>
#define CONDIT 1000

2. 創建R包步驟

新建R Package

1

選擇Package w/Rcpp, 並添加源文件。或者建立包以後,手動復制到src文件夾下。

2

R包的文件結構

這裡寫圖片描述

修改DESCRIPTION文件

將RcppArmadillo添加進Imports和LinkingTo中。

Package: RcppPackTest
Type: Package
Title: What the Package Does (Title Case)
Version: 0.1.0
Author: Who wrote it
Maintainer: The package maintainer <[email protected]>
Description: More about what it does (maybe more than one line)
    Use four spaces when indenting paragraphs within the Description.
License: What license is it under?
Encoding: UTF-8
LazyData: true
Imports: Rcpp (>= 0.12.11), RcppArmadillo
LinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo

Build & Reload 建立包

3. C++11標準問題

如果要使用C++11標準,第一種方法是在Makevars文件中添加如下代碼:

CXX = g++-4.8.1
PKG_CXXFLAGS = -std=c++11

第二種方法是在.cpp文件前添加// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]

以上就是Rcpp和RcppArmadillo創建R包實現方式的詳細內容,更多關於Rcpp和RcppArmadillo創建R包的資料請關註WalkonNet其它相關文章!

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