python中的Numpy二維數組遍歷與二維數組切片後遍歷效率比較
在python-numpy
使用中,可以用雙層 for循環對數組元素進行訪問,也可以切片成每一行後進行一維數組的遍歷。
代碼如下:
import numpy as np import time NUM = 160 a=np.random.random((NUM,NUM)) start = time.time() for i in range(NUM): for j in range(NUM): if a[i][j] == 1.0: pass end1 = time.time() for ii in range(NUM): b = a[ii,:] for jj in range(NUM): if b[jj] == 1.0: pass end2 = time.time() print("end1",end1-start) print("end2",end2-end1)
由於生成的是[0,1)中的數,因此兩種操作會遍歷所有的元素。多輪測試後,耗時如下:
當NUM為160時:
end1 0.006983518600463867
end2 0.003988742828369141
當NUM為1600時:
end1 0.71415114402771
end2 0.45178747177124023
結論:切片後遍歷更快
原因:
樓主還暫不明確
一個想法:
b=a[ii,:]
在numpy中,為瞭提高效率,這種切片出來的子矩陣其實都是原矩陣的引用而已,所以改變子矩陣,原矩陣還是會變的
所以在內層循環中,第二種方法是在那一行元素所在的內存進行尋找。而第一種方法是先定位到行,再定位到列,所以比較慢?
大傢是怎麼想的呢?
關於numba
在小數據量下的速度慢於普通操作
什麼是numba?
numba
實驗比較:
import numpy as np import time NUM = 160 from numba import jit a=np.random.random((NUM,NUM)) @jit(nopython=True) def fun1(a): for i in range(NUM): for j in range(NUM): if a[i][j] == 1.0: pass def fun2(a): for i in range(NUM): for j in range(NUM): if a[i][j] == 1.0: pass @jit(nopython=True) def fun3(a): for ii in range(NUM): b = a[ii,:] for jj in range(NUM): if b[jj] == 1.0: pass def fun4(a): for iii in range(NUM): b = a[iii,:] for jjj in range(NUM): if b[jjj] == 1.0: pass start = time.time() fun1(a) end1 = time.time() fun2(a) end2 = time.time() fun3(a) end3 = time.time() fun4(a) end4 = time.time() print("end1",end1-start) print("end2",end2-end1) print("end3",end3-end2) print("end4",end4-end3)
首先,當NUM為1600時,結果如下:
end1 0.2991981506347656 #無切片,有加速
end2 0.6372940540313721 #無切片,無加速
end3 0.08377814292907715 #有切片,有加速
end4 0.358079195022583 #有切片,無加速
其他條件相同的情況下,有切片的速度更快。同樣,有numba加速的也比沒加速的快。
但當NUM =160時,結果如下:
end1 0.29620814323425293 #無切片,有加速
end2 0.006980180740356445 #無切片,無加速
end3 0.08580684661865234 #有切片,有加速
end4 0.0029993057250976562 #有切片,無加速
有切片依舊比無切片的快。但是有numba加速的卻比沒有numba加速的慢。
原來@jit(nopython=True)隻是對函數進行修飾,第一次調用會進行編譯,編譯成機器碼,之後速度就會很快。
實驗代碼如下:
import numpy as np import time NUM = 160 from numba import jit a=np.random.random((NUM,NUM)) @jit(nopython=True) def fun1(a): for i in range(NUM): for j in range(NUM): if a[i][j] == 1.0: pass def fun2(a): for i in range(NUM): for j in range(NUM): if a[i][j] == 1.0: pass @jit(nopython=True) def fun3(a): for ii in range(NUM): b = a[ii,:] for jj in range(NUM): if b[jj] == 1.0: pass def fun4(a): for iii in range(NUM): b = a[iii,:] for jjj in range(NUM): if b[jjj] == 1.0: pass for b in range(4): start = time.time() fun1(a) end1 = time.time() fun2(a) end2 = time.time() fun3(a) end3 = time.time() fun4(a) end4 = time.time() print("end1",end1-start) print("end2",end2-end1) print("end3",end3-end2) print("end4",end4-end3) print("---")
結果如下:
end1 0.29421305656433105
end2 0.0059833526611328125
end3 0.08181905746459961
end4 0.0029909610748291016
—
end1 0.0
end2 0.005949735641479492
end3 0.0
end4 0.004008769989013672
—
end1 0.0
end2 0.006977558135986328
end3 0.0
end4 0.00399017333984375
—
end1 0.0
end2 0.005974292755126953
end3 0.0
end4 0.003837108612060547
—
結論:
numba
加速時,第一次需要編譯,需要耗時。之後調用就不需要瞭。
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