linux命令行下使用R語言繪圖實例講解

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使用系統：centos 6.4 64bit

在R語言中可以使用png()等函數生成圖片，例如： png(“aa.png”)可以生成圖片。

但是如果你是通過shell遠程連接到系統上，可能會碰到如下錯誤：

> png(“aa.png”)
錯誤於.External2(C_X11, paste(“png::”, filename, sep = “”), g$width,  : 
  無法打開PNG設備
此外: 警告信息：

In png(“aa.png”) : 無法打開鏈結到X11顯示”

分析：

打開R控制臺，輸入capabilities()，可以看到：

> capabilities()
  jpeg   png   tiff  tcltk   X11   aqua http/ftp sockets 
  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE  FALSE   TRUE   TRUE 
 libxml   fifo  cledit  iconv   NLS profmem  cairo 
  TRUE   TRUE   TRUE   TRUE   TRUE  FALSE  FALSE

可以看到png為false，因為生成圖片需要X11，但是shell是沒有X11的。

怎麼解決：

1.在X11模式下執行R語言命令，也就是在linux的桌面。如果你隻是在桌面上畫畫圖，那選擇這個方式就可以瞭。

2.不使用X11生成,使用 圖形渲染庫Cairo。比如我，需要用腳本，根據實時數據生成統計圖，那麼用這個方式就很方便。

安裝：

啟動R控制臺

安裝

install.packages("Cairo")

會讓你選擇安裝鏡像

--- 在此連線階段時請選用CRAN的鏡子 ---
CRAN mirror 
 
 1: 0-Cloud            2: Argentina (La Plata)    
 3: Argentina (Mendoza)      4: Australia (Canberra)    
 5: Australia (Melbourne)     6: Austria          
 7: Belgium            8: Brazil (BA)        
 9: Brazil (PR)         10: Brazil (RJ)        
11: Brazil (SP 1)        12: Brazil (SP 2)       
13: Canada (BC)         14: Canada (NS)        
15: Canada (ON)         16: Canada (QC 1)       
17: Canada (QC 2)        18: Chile           
19: China (Beijing 1)      20: China (Beijing 2) 
選一個北京的好瞭：20

安裝出錯

configure: error: Cannot find cairo.h! Please install cairo (http://www.cairographics.org/) and/or set CAIRO_CFLAGS/LIBS correspondingly.

所以我們需要先在系統中安裝cairo庫

yum -y install cairo* libxt*
安裝完成之後，重新執行：install.packages("Cairo")
installing to /usr/local/lib64/R/library/Cairo/libs
** R
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
* DONE (Cairo)
 
下載的程序包在
‘/tmp/RtmpNlGyf3/downloaded_packages'裡
更新'.Library'裡的HTML程序包列表
Making 'packages.html' ... 做完瞭。

安裝成功。

加載Cairo後，查看支持：

> library(Cairo)
> Cairo.capabilities()
  png  jpeg  tiff  pdf  svg   ps  x11  win raster 
 TRUE FALSE FALSE  TRUE  TRUE  TRUE  TRUE FALSE  TRUE 
說明已經支持用cairo生成圖片瞭。
例如可以使用如下命令生成PNG：
CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)

附上一個測試小程序，主要為瞭說明用法：

#vim test.r
library(Cairo)

CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)

plot(5,4)

保存後執行：

[root@localhost ~]# Rscript test.r 
 
R version 3.1.0 (2014-04-10) -- "Spring Dance"
Copyright (C) 2014 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
> library(Cairo)
> CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)
> plot(5,4)
>

在當前目錄下可以看到生成瞭圖片

[root@localhost ~]# ll
總用量 84
-rw-r--r--. 1 root root 6832 5月 13 10:33 out.png
-rw-r--r--. 1 root root  71 5月 13 10:32 test.r

到此這篇關於linux命令行下使用R語言繪圖實例講解的文章就介紹到這瞭,更多相關linux命令行下使用R語言繪圖內容請搜索WalkonNet以前的文章或繼續瀏覽下面的相關文章希望大傢以後多多支持WalkonNet！

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